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水利工程学科历史悠久。水为生命之源、生态之基、生产之要，自古以来，人类即与水为邻，与水相伴，人类文明发展史与水紧密相关，与水利工程密切相关。人类已有几千年用水治水经验，在欧洲文艺复兴和工业革命以来，在系统的理论研究和大规模的工程实践的基础上，水利工程已形成一套相对完整的学科体系。在新的历史时期，人类社会发展面临人口、资源和环境的巨大挑战，水作为基础性的自然资源和战略性的经济资源以及生态环境的控制性要素，在国民经济和国家安全中的重要战略地位日益突出。伴随社会科学和其它自然科学技术的发展，一大批有关用水治水的新思维、新概念、新理论、新方法、新技术、新工艺、新材料以及新的管理实践相继涌现，不断丰富完善水利工程学科的理论与实践体系。
水利工程学科的发展经历了从工程水利、资源水利到民生水利的转变，防御洪涝灾害、保障生活生产用水、治理水土流失和水环境污染等，是水利学科目前面临的关系国计民生的重要任务。给洪水以出路、洪水资源化，开源节流、建设节水型社会、实现水资源的高效利用，控污治污、发展绿色经济、充分依靠大自然的自我修复能力等等将对水资源的开发、利用和保护以及水利工程的规划、设计、建设、管理理念产生深远的影响，水利工程学科需要从理论上、技术上进行不断创新。