通渭县李店中学筹建于1957年，1958年10月开始招收小学附设初中班，1959年3月正式建校并挂牌，定名为“通渭县第三中学”，开始招收首届学生，1963年更名为“通渭县第二中学”，1969年更名为通渭县李店中学至今。