2017年高考，重点本科上线702人，重本率69.1%；本科上线1003人，本科率98.9%。其中一名学生以681分获广东省理科总分第17名，广州市第六名，被北京大学提前录取。 2016年高考中，学校重点本科上线704人，上线率68.5%；本科以上上线1004人，上线率98%。总分600分以上92人。重本上线人数居广州市首位，重本上线率居广州市区属高中首位。 2015年高考，重点本科上线人数643人，位居广州市各高中之首；重本上线率65.43%，位居广州市各区属高中之首，重本率比去年增加6个百分点；本科A上线人数942人，上线率达93%，本科B上线人数990人，上线率97.22%。其中理科总分650分以上有35人，640分以上有72人，630分以上有118人，620分以上185人；文科总分630分以上4人，620分以上有11人，610分以上有25人。一批学生高考单科成绩位居省、市前列。 2014年高考，参加高考总人数984人，重点本科584人（包括体艺类），重本上线率59.3%，本A上线率883人，上线率达90%。文科最高分661分，位列全省第32名，文科总分630分以上8人，600分以上72人。理科最高分674分，理科总分650分以上19人，630分以上55人，600分以上199人。其中一名学生荣获理综全省状元，一名学生语文位列全省第三。 2013年高考，广东仲元中学重本率达到44.5%，与去年基本持平。 2012年广东高考，仲元中学重本率44.5%，比去年增长1.25%。

学校升学目标是美国前30名大学（以美国作为代表），美国有4000多所大学，排位前50的大学都是世界知名大学，排位前30的大学更是世界顶级大学。排位前30的大学除了考察学生的学习成绩外，还会特别看重学生的综合能力和个人特长，入学标准十分严格，能进入排位前30大学学习的学生基本上都是品学兼优。