新疆农业大学科学技术学院成立于2002年7月，是经国家教育部批准的实施普通高等学校本科全日制教育的独立学院。
学院位于乌鲁木齐市南昌路42号。校园环境优雅，基本设施先进，办学条件齐备。科技学院独立校区建设规划正在实施。
学院采用全新的教育理念，新型管理体制和运行机制，独立开展教学、学生管理及学院建设发展等各项工作，积极构建“学院自主、社会参与、市场介入、政府调控”的良性互动发展环境。学院设有综合管理部、教务管理部、学生管理部（下设招生办公室）、资产管理部、财务管理部等五个行政机构，并将筹建语言文学与教育学部、经济与商业学部、管理与法律学部、信息与工学学部、生物学部等五个专业教学部。学院实行全员聘任制和岗位负责制，根据精干高效的原则，注重能力，按需设岗。现聘任专职教师295人，其中教授32人，副教授100人；在职管理人员11人。
科学技术学院依托新疆农业大学的学科基础，根据地方和区域社会经济建设及城市化、城镇化发展需要，结合西部大开发、加入WTO和自治区国民经济结构调整的实际，努力创造条件，加快发展社会急需的短线专业，目前设有经济学、国际经济与贸易、英语、电子信息科学与技术、水利水电工程、人力资源管理、食品科学与工程等19个本科专业（方向），现有在校学生2146人。
学院面向全国招生。学生毕业后由新疆农业大学科学技术学院授予国家统一印制的毕业证书，并经新疆农业大学学位委员会审核，授予新疆农业大学学位证书。
学院成立以来，以相对独立地组织教学为原则，以执行特色教学计划为核心，实施了“新疆农业大学科学技术学院特色教学”这一开拓性、创新性工作，采取了一系列教学改革措施，形成了学院鲜明的教学特色。学院具有一支高素质的专职学生工作管理队伍，制定了严格的管理制度，引导学生党团组织和学生会组织开展了丰富多彩的课余活动，为学生提供了施展才华的天地。学院制定了对贫困生的帮扶方法，采取奖、助、勤、贷等多种形式为贫困生解决实际困难。
在自治区教育厅的领导下，在新疆农业大学的指导和帮助下，学院积极贯彻国家教育部关于发展独立学院的各项指示精神，认真落实建设独立学院的各项政策措施，不断深化改革，加强科学管理，提高教育质量。
