中国科学院生态环境研究中心（以下简称生态环境中心）始建于1975年，时为经国务院批准成立的中国科学院环境化学研究所，1986年与中国科学院生态学研究中心（筹）合并，改为现名。生态环境中心1999年首批进入中科院知识创新工程试点，2011年首批列入中科院“创新2020”和“一三五”发展规划择优支持研究所，2015年获批建设“中国科学院生态环境科学科教融合卓越中心”。
生态环境中心以“国家生态环境安全与可持续发展”为战略主题，充分发挥环境科学、环境工程和生态学三大学科的综合优势，将国际环境科学与生态学研究前沿与国家环境保护与生态建设的重大需求紧密结合，不断突破关系到国家生态安全、环境健康和可持续发展的重大科学理论和关键技术，为我国生态文明建设、实现人与自然的协调发展做出基础性、战略性、前瞻性科技创新贡献，将生态环境中心建设成为我国生态环境科学应用基础研究和技术创新基地、高级专门人才培养基地，成为国内一流、国际上有重要影响的生态环境科学与技术综合性研究机构。
