石河子大学位于被誉为戈壁明珠的新疆石河子市，是国家 “211工程”重点大学，是“中西部高校综合实力提升工程”（一省一校）高校和“中西部高校基础能力建设工程”高校，入选“2011计划”、"卓越医生教育培养计划"、"卓越工程师教育培养计划"、"卓越农林人才教育培养计划"，由教育部和新疆生产建设兵团共建，是国家西部重点建设十四所高校之一，“中西部高校联盟”成员。

新疆大学，简称新大，位于新疆维吾尔自治区首府乌鲁木齐，是1978年确定的全国重点大学，国家“211工程”建设高校、国家西部大开发重点建设高校、中西部高校基础能力建设工程高校、“、”卓越工程师教育培养计划“、”卓越法律人才教育培养计划“、教育部与新疆维吾尔自治区人民政府共建高校，“中西部高校联盟”成员。

新疆师范大学创立于1978年12月，其前身是乌鲁木齐市第一师范学校和新疆教师培训部。是“中西部高校基础能力建设工程高校”之一。截至2013年，学校有22个学院，有56个本科招生专业、34个专科专业，覆盖了经济学、法学、教育学、文学、历史学、理学、工学、管理学8个学科门类，拥有2个自治区重点学科，1个自治区重点实验室、11个校级优先发展学科、5个校级人文社会科学重点研究基地、4个校级重点实验室。

塔里木大学原名塔里木农垦大学，位于新疆南部塔里木河畔的阿拉尔市。是中西部高等教育振兴计划高校，教育部实施援疆学科建设计划；国家首批卓越农林人才教育培养计划改革试点高校，指定浙江大学、武汉大学、中国农业大学、东华大学、兰州大学、华中农业大学、东北农业大学、北京化工大学等著名高校对口支援塔里木大学。

新疆财经大学，是新疆唯一一所财经类高等学府，也是新疆维吾尔自治区重点建设的五所高校之一。学校坐落在新疆首府乌鲁木齐市风景秀丽的北京路上，南、北两个校区总面积近62万平方米。学校的前身是1950年成立的新疆省人民政府干部学校，1959年升格为新疆财经学院；2000年，原新疆财经学院、新疆经济管理干部学院、新疆财政学校含新疆税务学校合并成立新的新疆财经学院。2007年，正式更名为新疆财经大学。

伊犁师范学院是一所隶属新疆维吾尔自治区管理的普通高等师范学校。学院前身是1948年成立的新疆省立伊犁专科学校，以后曾先后更名为阿合买提江专科学校、伊犁师范学校。1980年5月，经国务院批准升格为全日制普通本科高等学校，定名伊犁师范学院。现已更名为伊犁师范学院。

新疆农业大学是自治区重点建设的一所农业高等院校，前身为新疆八一农学院，是经毛主席和中央军委同意，由王震将军于1952年创建的本科高校。1995年4月21日经原国家教委批准，更名为新疆农业大学。2006年本科教学工作水平评估优秀。2014年5月，成为国家林业局与自治区人民政府共建高校，国家首批卓越农林人才教育培养计划改革试点高校。

昌吉学院坐落在昌吉市，距首府乌鲁木齐38公里，有乌奎高速、机场高速和乌昌高等级公路与之相连。前身是成立于1959年的昌吉师范学校，1985年升格为昌吉师范专科学校，2001年5月经国家教育部和自治区人民政府批准升格为普通本科院校昌吉学院。学院现有南、北两个校区。

喀什大学坐落于中国历史文化名城、中国优秀旅游城市和中国最西部的边陲城市——新疆喀什市，是一所多民族、多学科、多形式的综合性、应用型现代化大学，中西部高校基础能力建设工程高校，也是祖国最西部的大学。学院的前身是新疆喀什师范专科学校。

新疆医科大学，坐落于新疆维吾尔自治区首府乌鲁木齐市风景秀丽的鲤鱼山下，是一所具有光荣传统的省属重点大学，入选“卓越医生教育培养计划”，是国家卫生部和新疆自治区共建高校。其前身新疆医学院始建于1954年，1956年建成招生，1998年6月新疆医学院与新疆中医学院合并成立了新疆医科大学，2011年11月4日，国家卫生部与新疆自治区签署了共建该校的协议。