南头中学前身为兴建于1801年的凤岗书院，至今已有200年历史。1906年改名为凤岗学校，课程不只四书五经，还开设了近代自然科学和社会科学。 民国初年，凤岗书院又改名为宝安县第一高等小学，学生200人。1926年扩办初中班，1928年改名为宝安县立第一初级中学，有来自宝安县、东莞县和香港新界的学生400余人。 南头中学有着光荣而悠久的革命传统。正值宝安县建党时期的1924年秋天，广州农民运动讲习所学生、共产党员黄学增等三人来到宝安，在燕川一带发展了宝安县第一批共产党员。1926年初，中共宝安县委成立，县委机关设在南头城关的郑氏宗祠，以南头城为中心的农民运动风起云涌，近在咫尺的宝安县第一高等小学师生深受革命熏陶。1938年10月，日寇从大亚湾登陆，放火焚烧南头城，宝安一小校舍被毁，被迫停办，一批学生参加了惠东宝抗日游击队（1943年12 月改名为东江抗日游击纵队）。1945年抗战胜利，当时的陈仲轩校长远赴美国募捐，在美华侨以桑梓赤诚，鼎力捐资修建校舍，学校得以复办，更名为宝安县立第一初级中学。 1949年10月16日南头解放后，宝一中师生以毛泽东提倡的“身体好、学习好、工作好”为准则，推行“团结、紧张、严肃、活泼”的延安作风，学校愈办愈好，名声在外。香港等地学子自古就有远赴南头凤岗书院就学的风气，解放后更是舍近求远，从新界而来的学生络绎不绝。香港沙田人、后为我国著名电影演员的谢芳，1953、1954年曾经在此就读。1958年，宝安县第一中学改名为南头中学，首届高中毕业生考上大学者达一百余人。同年，南头中学被评为粤中专区红旗学校。