新干县第二中学前身是江西省新干县金川中学，创办于1977年，地处新干县城东北郊。2003年8月，根据新干县教育网点布局调整之需要，以原新干县金川中学高中部为基础，合并原新干县七琴中学高中部，原新干县三湖中学高中部，组建新干县第二所公办高级中学，定校名为江西省新干县第二中学，简称新干二中。