普埃布拉功勋自治大学是墨西哥普埃布拉最古老、规模最大的大学，该学校于1578年4月15日成立为ColegiodelEspírituSanto，在西班牙殖民时代的大部分时间由耶稣会赞助，之后于1825年成为公立大学，最终于1937年进入公立大学。在普埃布拉市中心的许多BUAP建筑中可以看到宗教起源，因为它曾经是殖民地时代的教堂。主校区位于普埃布拉市，还有超过9个设施分布在全州各地。目前，它是参加CERN爱丽丝实验的105所研究所之一。